Forscher am Institut für Informationswissenschaft
des Französischen Nationalen Wissenschaftszentrums Labor der Informatik "Gaspard Monge" (LIGM) Université Gustave Eiffel (umbenannt von Université Paris EST - Marne-la-Vallée) Bât Copernic, 5 Bd Descartes Champs-sur-Marne, 77454 Marne-la-Vallée Phone: +33 1 60 95 77 49 E-mail: Büro: 4B 105, bâtiment Copernic Zum Senden verschlüsselter Mails, hier mein PGP public key (fingerprint 98D5 9418 8AEA 7C23 F535 F63C 2D85 72C3 95F6 6C5B). Meine Interessengebiete sind unter anderem
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Ich bin engagiert im Peer Community In (PCI) Mathematical & Computational Biology (MCB) (siehe auch dieses Erklärvideo sowie dieses PDF mit Antworten zu häufigen Kritikpunkten) |
OC von RECOMB-CG 2019 |
PC von SOFSEM 2020 |
Sudoku | Ein regelbasierter Sudoku Löser, der die "transitive chain analysis" implementiert. |
TransEd | Ein Programm zum Lösen des Transitivity Editing problems. |
GCClust | Ein Programm (mit graphischer Benutzeroberfläche) zum Lösen des Consensus Clustering problems. |
2LP | Ein Programm zum Lösen des Two-Layer Planarization problems (veraltet, wird aktuell erneuert). |
EE | Ein Programm zum Lösen des Eulerian Extension problems (geschrieben in Java von Georg Hieronimus). |
CoilCoater | Ein Programm zum Lösen des Colorful Independent Set problems (geschrieben von René v. Bevern). |
Status Sequence Analyser | Ein Programm zum Rekonstruieren eines caterpillar graphs aus einer "Status"-Sequenz. |
Genome Scaffolder | Ein Programm zum verbinden von contigs in fasta Format zu scaffolds mit Hilfe von paired end Information gegeben als scaffold Graph. Benötigt CPLEX. |
In 2017 gab ich eine Kurzvorlesung über SCAFFOLDING an der Universität von Montpellier. [Folien (eng)]
In 2018 gab ich eine Kurzvorlesung zur algorithmischen Bioinformatik an der ENS Cachan.
In 2020 gebe ich eine Kurzvorlesung zur algorithmischen Bioinformatik an der ENS Saclay. [Folien (eng): Teil 1, Teil 2] Programmierprojekt (eng): description, test generator]