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Chargé de recherche de l'Institut des sciences de l'information et de leurs interactions
du CNRS Laboratoire d'Informatique "Gaspard Monge" (LIGM) Université Gustave Eiffel (ancien Université Paris EST - Marne-la-Vallée) Bât Copernic, 5 Bd Descartes Champs-sur-Marne, 77454 Marne-la-Vallée Phone: +33 1 60 95 77 49 E-mail: Bureau: 4B 105, bâtiment Copernic Pour m'envoyer des mails chiffré, utilisez mon PGP clé publique (empreinte 98D5 9418 8AEA 7C23 F535 F63C 2D85 72C3 95F6 6C5B). Je m'interesse de
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| Je suis engagé dans le projet Peer Community In (PCI) Mathematical & Computational Biology (MCB) (voir cette video explicative ansi que ce PDF répondant aux critiques) |
| OC de RECOMB-CG 2019 |
| PC de SOFSEM 2020 |
| Sudoku | Une programme qui résout des sudoku en utilisant "transitive chain analysis". |
| TransEd | Une programme qui résout le problième Transitivity Editing. |
| GCClust | Une programme (avec interface visuelle) qui résout le problème Consensus Clustering. |
| 2LP | Une programme qui résout le problème Two-Layer Planarization (obsolète, nouvelle implementation en train). |
| EE | Une programme qui résout le problème Eulerian Extension (ecrit dans Java par Georg Hieronimus). |
| CoilCoater | Une programme qui résout le problème Colorful Independent Set (ecrit par René v. Bevern). |
| Status Sequence Analyser | Une programme qui calcule un caterpillar-arbre descrit par une séquence des "stati". |
| Genome Scaffolder | Une programme qui produit des scaffolds à partir des contigs en format fasta en utilisant des informations paired end donné par un graph de scaffold. Il faut avoir CPLEX. |
En 2017, j'ai donné un cours sur l'echaffaudage genomique à l'université de Montpellier. [diapos (anglais)]
En 2018, j'ai donné un cours sur la bioinformatique à l'ENS Cachan.
En 2020, je donne un cours sur la bioinformatique à l'ENS Saclay. [diapos (anglais): part 1, part 2] projet: description, test generator]