Algorithmique pour la bioinformatique - Master 2 Algorithmique, Bioinformatique & Combinatoire de l'Institut Gaspard-Monge

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Descriptif global du cours

Cours

Philippe Gambette : algorithmique et phylogénie
- Séances :
  - 15 octobre de 10h45 à 12h45 : panorama, arbres, triplets, quadruplets, clusters, splits, distances additives et ultramétriques, algorithmes UPGMA et BUILD, dessin d'arbres
  - 29 octobre de 10h45 à 12h45 : comparaison d'arbres (MAST, MCT, tanglegrams), distances entre arbres, parcimonie et vraisemblance, génération aléatoire d'arbres
  - 12 novembre de 8h30 à 10h30 : correction des exercices 1 et 3, enjeux des données réelles, maximisation de la compatibilité des triplets : preuve de NP-complétude et algorithme de complexité paramétrée
- Cours imprimable (séances 1, 2 & 3)
Anthony Labarre :
- Séances :
  - 21 novembre de 10h45 à 12h45
  - 28 novembre de 10h45 à 12h45
  - 5 décembre de 10h45 à 12h45
- Supports de cours
Gregory Kucherov :
- Séances :
  - 9 décembre de 14h à 17h
  - 16 décembre de 14h à 17h
Stéphane Vialette :
- Séances :
  - 21 janvier de 9h à 12h
  - 28 janvier de 9h à 12h
- Support de cours : cours 1, cours 2

Date d'examen à venir... (janvier ou février)