Algorithmique pour la bioinformatique - Master 2 Algorithmique, Bioinformatique & Combinatoire de l'Institut Gaspard-Monge
N'hésitez pas à
me contacter en cas de problème ou pour toute question, en indiquant
"[M2Bioinfo]" dans le sujet du mail.
Descriptif global du cours
Cours
-
Philippe Gambette : algorithmique et phylogénie
- Séances :
- 15 octobre de 10h45 à 12h45 : panorama, arbres, triplets, quadruplets, clusters, splits, distances additives et ultramétriques, algorithmes UPGMA et BUILD, dessin d'arbres
- 29 octobre de 10h45 à 12h45 : comparaison d'arbres (MAST, MCT, tanglegrams), distances entre arbres, parcimonie et vraisemblance, génération aléatoire d'arbres
- 12 novembre de 8h30 à 10h30 : correction des exercices 1 et 3, enjeux des données réelles, maximisation de la compatibilité des triplets : preuve de NP-complétude et algorithme de complexité paramétrée
-
Cours imprimable (séances 1, 2 & 3)
-
Anthony Labarre :
- Séances :
- 21 novembre de 10h45 à 12h45
- 28 novembre de 10h45 à 12h45
- 5 décembre de 10h45 à 12h45
- Supports de cours
-
Gregory Kucherov :
- Séances :
- 9 décembre de 14h à 17h
- 16 décembre de 14h à 17h
-
Stéphane Vialette :
- Séances :
- 21 janvier de 9h à 12h
- 28 janvier de 9h à 12h
- Support de cours : cours 1, cours 2
Examen
Date d'examen à venir... (janvier ou février)