Article dans une revue

2014

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Guillaume Blin, Paola Bonizzoni, Riccardo Dondi, Romeo Rizzi, Florian Sikora. Complexity Insights of the Minimum Duplication Problem. Theoretical Computer Science, 2014, 530, pp.66-79. ⟨hal-00948488⟩

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2013

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Guillaume Blin, Romeo Rizzi, Florian Sikora, Stéphane Vialette. Minimum Mosaic Inference of a Set of Recombinants. International Journal of Foundations of Computer Science, 2013, 24 (1), pp.51-66. ⟨10.1142/S0129054113400042⟩. ⟨hal-00679269⟩

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2012

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Guillaume Blin, Paola Bonizzoni, Riccardo Dondi, Florian Sikora. On the Parameterized Complexity of the Repetition Free Longest Common Subsequence Problem. Information Processing Letters, 2012, 112 (7), pp.272-276. ⟨10.1016/j.ipl.2011.12.009⟩. ⟨hal-00637255v2⟩

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2010

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Guillaume Blin, Florian Sikora, Stéphane Vialette. Querying Graphs in Protein-Protein Interactions Networks using Feedback Vertex Set. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2010, 7 (4), pp.628-635. ⟨hal-00619763⟩

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Communication dans un congrès

2013

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Guillaume Blin, Paola Bonizzoni, Riccardo Dondi, Florian Sikora. On the Parameterized Complexity of the Repetition Free Longest Common Subsequence Problem. International Workshop on Approximation, Parameterized and EXact algorithms (APEX'13), Jul 2013, Riga, Latvia. 3 pp. ⟨hal-00949104⟩

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2012

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Xiao Yang, Florian Sikora, Guillaume Blin, Sylvie Hamel, Roméo Rizzi, et al.. An algorithmic view on multi-related-segments: A unifying model for approximate common interval. 9th annual conference on Theory and Applications of Models of Computation (TAMC), May 2012, Beijing, China. pp.319-329, ⟨10.1007/978-3-642-29952-0_33⟩. ⟨hal-00630150v2⟩

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Guillaume Blin, Paola Bonizzoni, Riccardo Dondi, Romeo Rizzi, Florian Sikora. Complexity Insights of the Minimum Duplication Problem. 38th International Conference on Current Trends in Theory and Practice of Computer Science (SOFSEM 2012), Jan 2012, Špindleruv Mlýn, Czech Republic. pp.153-164. ⟨hal-00629047⟩

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2011

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Guillaume Blin, Romeo Rizzi, Florian Sikora, Stéphane Vialette. Minimum Mosaic Inference of a Set of Recombinants. 17th Computing: the Australasian Theory Symposium (CATS'11), Jan 2011, Perth, Australia. pp.23-30. ⟨hal-00620371⟩

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Guillaume Blin, Guillaume Fertin, Hafedh Mohamed-Babou, Irena Rusu, Florian Sikora, et al.. Algorithmic Aspects of Heterogeneous Biological Networks Comparison. COCOA 2011, 2011, Zhangjiajie, China. pp.272-286, ⟨10.1007/978-3-642-22616-8_22⟩. ⟨hal-00606375⟩

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2010

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Sylvain Guillemot, Florian Sikora. Finding and counting vertex-colored subtrees. International Symposium on Mathematical Foundations of Computer Science (MFCS), Jun 2010, Brno, Czech Republic. pp.405-416. ⟨hal-00455134v3⟩

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Guillaume Blin, Florian Sikora, Stéphane Vialette. GraMoFoNe: a Cytoscape plugin for querying motifs without topology in Protein-Protein Interactions networks. Bioinformatics and Computational Biology (BICoB'10), Mar 2010, Honolulu, United States. pp.38-43. ⟨hal-00425661⟩

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2009

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Guillaume Blin, Florian Sikora, Stéphane Vialette. Querying Protein-Protein Interaction Networks. 5th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA'09), May 2009, Fort Lauderdale, United States. pp.52-62. ⟨hal-00620391⟩

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Guillaume Blin, Guillaume Fertin, Florian Sikora, Stéphane Vialette. The Exemplar Breakpoint Distance for non-trivial genomes cannot be approximated. WALCOM 2009, 2009, Kolkata, India. pp.357-368. ⟨hal-00416491⟩

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Thèse

2011

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Florian Sikora. Aspects algorithmiques de la comparaison d'éléments biologiques. Sciences agricoles. Université Paris-Est, 2011. Français. ⟨NNT : 2011PEST1048⟩. ⟨pastel-00667797⟩

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