Article dans une revue

2016

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Karel Brinda, Valentina Boeva, Gregory Kucherov. RNF: a general framework to evaluate NGS read mappers. Bioinformatics, 2016, 32 (1), pp.136-139. ⟨10.1093/bioinformatics/btv524⟩. ⟨hal-01220199v2⟩

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2015

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Karel Brinda, Maciej Sykulski, Gregory Kucherov. Spaced seeds improve k-mer-based metagenomic classification. Bioinformatics, 2015, ⟨10.1093/bioinformatics/btv419⟩. ⟨hal-01250752⟩

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Communication dans un congrès

2016

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Petr Červenka, Karel Brinda, Michaela Hanousková, Petr Hofman, Radek Seifert. Blind Friendly Maps: Tactile Maps for the Blind as a Part of the Public Map Portal (Mapy.cz). ICCHP 2016: 15th International Conference on Computers Helping People with Special Needs, Jul 2016, Linz, Austria. ⟨hal-01295585⟩

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2014

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Karel Brinda. Languages of lossless seeds. Proceedings of the 14th International Conference on Automata and Formal Languages (AFL), May 2014, Szeged, Hungary. pp.139-150, ⟨10.4204/eptcs.151.9⟩. ⟨hal-01018062⟩

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Thèse

2016

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Karel Brinda. Novel computational techniques for mapping and classification of Next-Generation Sequencing data. Information Theory [cs.IT]. Université Paris-Est, 2016. English. ⟨NNT : 2016PESC1027⟩. ⟨tel-01484198v3⟩

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Poster de conférence

2016

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Petr Červenka, Karel Brinda, Radek Seifert, Petr Hofman. Blind Friendly Maps. International Conference on Sensory issues and Disability: Touch to learn, touch to communicate, Mar 2016, Paris, France. 2016. ⟨hal-01289174⟩

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Pré-publication, Document de travail

2016

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Karel Brinda, Valentina Boeva, Gregory Kucherov. Dynamic read mapping and online consensus calling for better variant detection. 2016. ⟨hal-01323188⟩

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